2016
內戰
Tony因為擔心再度發生類似蘇科維亞的事件，於是想將防衛系統交由政府管理；但Steve擔心政府內部有九頭蛇殘黨將防衛系統用於錯誤的地方導致華盛頓事件再度上演，於是產生意見分歧。Natasha支持Tony的想法，但也可以理解Steve的擔憂。
記者會的爆炸，經追查後發現疑似是Bucky所為，部分復聯成員因阻礙政府追捕Bucky遭到通緝。而爆炸案的真正幕後黑手為前蘇科維亞軍官Zemo所為，因家人於蘇科維亞之戰中喪身，為報復復聯團隊便陷害Bucky，利用復仇者們過往的恩怨引發內戰以瓦解復仇者聯盟。
Tony因Zemo帶出的過往恩怨而對Steve及Bucky懷恨在心，在提供爆炸事件的真相並將防衛系統所有權交由政府後宣布退出復仇者聯盟。分裂後的復仇者聯盟剩下Steve、Natasha、Sam、Bucky、Clint、Vision、Wanda。
逃亡期間
Natasha為了不連累Karlia，決定獨自離開，並決定若真的需逃亡一輩子便會一輩子遠離Karlia。Karlia則覺得無論發生什麼事她都只想待在Natasha身邊，所以對於只留下一封信便離去的Natasha感到十分氣憤，但同時也很擔心對方的安危。
Natasha與Yelena相認後，Yelena於談話間知道了Karlia與Natasha的關係，同時也對於Natasha丟下Karlia一事感到不滿。